实践中，要申请离婚亲子鉴定，需要注意以下的问题：

1、需尊重女方的意见

如果女方不同意做鉴定，那么法院也不能继续进行，即使这个鉴定具有至关重要的作用。

2、需尊重年龄十周岁以上的子女的意见

在离婚时，孩子已经在十周岁以上的，也要听取子女们的意见，子女反对做亲子鉴定的，法院也不能进行。

另外，如果取得女方、十周岁以上子女的同意后，申请人也不是可以随意要求的，比如单独向法院提出作亲子鉴定的，那么将不被允许。因为，在实践中，离婚亲子鉴定附随诉讼离婚纠纷或者子女抚养费纠纷。

当然，在起诉离婚时，即使得不到女方和子女的同意，也不是就证明不了非亲生了，因为可以提供其他能够证明的证据，比如血型匹配依据。法院在审理时，会根据提供的其他证据，并根据男方的主张以及女方对亲子鉴定的态度，依法做出推定。